C’est une des très belles églises de la Ville de Québec. Construite en 1882, selon les plans (style Second Empire, modèle inspiré de l’église de la Trinité de Paris, construite 20 ans plus tôt) de l’architecte québécois Joseph-Ferdinand Peachy (1830-1903; œuvre maîtresse), l’église a remplacé celle conçue par Charles Baillargé qui a été détruite par le gros incendie de juin 1881, en même temps qu’une bonne partie du faubourg Saint-Jean. Un élément particulier de cette église est son porche à arcades ouvert comme dans les anciennes églises chrétiennes. Le clocher, doté d’un carillon à quatre cloches, est couronné d’une flèche conique encadré de deux tours en retrait. Les vitraux ont été réalisés par les Ateliers de Bernard Léonard entre 1887 et 1912. L’église Saint-Jean-Baptiste est classée monument historique depuis 1991 et son orgue, monté en 1886 par Napoléon Déry (1843-1908) et agrandi par la maison Casavant en 1921, est classé objet patrimonial depuis 1979. Malheureusement, depuis sa fermeture au culte en mai 2015, le sort réservé à cette église demeure encore inconnu (Carrefour de généalogie de l'Amérique francophone ???) et son état, avec les rigueurs du climat canadien, ne cesse de se détériorer. Elle n’est plus ouverte à la visite, sauf pour quelques rares évènements spéciaux, mais on peut voir quelques éléments intérieurs sur des photos exposées dans des fenêtres-cadres sous le porche.